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1957年 上海医药工业研究所成立,隶属于化工部。
1959年 七步合成法生产醋酸可的松获国家科学发明奖。
1961年 更名为上海医药工业研究院。
1964年 “新型抗日本血吸虫口服有效药物——呋喃丙胺”,获国家科学发明一等奖。
1965年 抗菌素研究室大批人员及设备迁至四川成都,筹建四川抗菌素工业研究所。
1978年 “抗肿瘤药嘧啶苯芥”、“53号探亲避孕药”、“维C生产工艺重大技术革新”等39 个项目获全国科学大会奖。
1979年 隶属于国家医药管理总局。国务院批准我院药物化学、微生物药物学、药剂学、药理 学、生化药物学、制药工程学6个学科的硕士学位授予权,开始招生。

上海医药工业研究院实验药厂成立。
1980年 作为国务院批准的首批博士学位授予单位,药物化学、微生物药物学被列为博士点。

雷兴翰、童村被国务院批准为博士生导师。

“固定化细胞制备氨基青霉烷酸(6-APA)新工艺”获国家科学发明三等奖。
1981年 “硫酸钡干燥泡悬剂新处方及新工艺”获国家科学发明三等奖。
1982年 “高纯度尿激酶的制造方法和人尿中尿激酶抽提吸附装置”,获国家科学发明二等奖。

“氯甲左箭毒的试制研究”获国家科学发明三等奖。
1983年 复方苯酚糊剂获国家科学发明三等奖。
1984年 “维生素B6恶唑法合成新工艺”、“磷酸哌喹(抗矽14)治疗矽肺”、“N,N—二乙基 硫辛酰胺(抗放药物—206)”获国家科学发明三等奖。
1986年 许文思、张椿年、杨福秋被国务院学位委员会批准为博士生导师。
1987年

国家医药管理局药品包装材料检测中心在我院成立。

“测定血清胆固醇用酶联试剂的开发研究”、“巯甲丙脯酸”获国家科技进步三等奖。

1988年 南翔实验药厂成立。现为上海医工院医药股份有限公司南翔生产基地

“头孢菌素C菌种发酵提取及裂解的研究”获国家科技进步三等奖。
1989年 抗疟新药——青蒿琥酯”获国家科学发明三等奖、“左旋氨基丁醇消旋工艺”获国家 科技进步三等奖。
1990年 实验药厂浦东分厂成立。现为上海现代制药股份有限公司浦东生产基地。

“水溶性栓剂基质”--聚氧乙烯(40)硬酸脂”获国家科技进步三等奖。
1991年 实验药厂宝山分厂成立,后更名宝山药厂。现在注销。
1992年 “抗肿瘤新药米托蒽醌的研究”获国家科技进步三等奖。
1993年 “阿霉素生产工艺及劳动保护研究”获国家科技进步三等奖。

朱宝泉、李惠庭被国务院学位委员会批准为博士生导师。

实验药厂更名为上海医药工业研究院亚东药业公司。现为上海医工院医药股份有限公司 下属公司。
1994年 许文思、周后元当选中国工程院院士。
1995年 国家计委批准在我院建立药物制剂国家工程研究中心。

“降血糖药格列齐特的研制”、“盐酸地尔硫卓及其片剂研究”获国家科技进步三等奖。
1996年 侯惠民当选中国工程院院士。

“丙烯酸树脂的试制和应用”获国家科技进步三等奖。
1997年 名誉院长雷兴翰、童村铜像揭幕。

博士后流动站正式启动。

“抗肿瘤药紫杉醇的研究和开发”获国家科技进步三等奖。

“头孢菌素C菌种发酵工艺的研究”获国家科技进步三等奖。
1998年 新增药剂学博士学位点。
1999年 国家经贸委在我院设立国家医药工业信息中心。

“抗肿瘤药依托泊甙合成新工艺”获国家技术发明三等奖。

抗腰椎间盘突出症一类新药“注射用胶原酶的研究”获国家科技进步三等奖。
2000年 国务院学位委员会授予我院药学一级学科单位。

与上海交通大学共同创办上海交通大学药学院。

由原国家药品监督管理局所属的事业单位转制为中央企业工作委员会下属的国有重要骨干企业。

作为主发起人成立“上海现代制药股份有限公司”。
2001年 和科技部、上海市政府等合资的国家上海新药安全评价研究中心通过科技部验收并开始运行。

医药数字图书馆“医药之门”开通,现为“中国医药数字图书馆”
2002年 上海现代制药股份有限公司通过国家GMP认证。
2003年 隶属于国务院国有资产监督管理委员会。
2004年 上海现代制药股份有限公司A股在上海证券交易所上市。
2005年 上海医工院医药股份有限公司成立。
2006年 “环孢菌素A生产新工艺关键技术及其应用”项目获国家科学技术进步二等奖

“新头孢菌素——头孢硫脒”项目国家科技发明二等奖
2007年 2月,王文梅以“结晶头孢硫脒及其制备方法和用途”获得2006年度国家技术发明二等奖。
3月1日,在上海艺海剧院隆重举行建院50周年庆典。全国人大党委会副委员长韩启德为我院建院五十周年题词。
3月22日,国务院国资委副主任黄丹华来院视察工作。
3月23-25日院信息中心与英国Scientific Update公司联合主办第三届国际精细化工技术培训。
4月,陈代杰研究员等人完成的“万古霉素产业化关键技术”项目荣获2006年上海市科技进步一等奖,谢保源研究员等人完成的“丙泊酚注射液”项目荣获2006年上海市科技进步三等奖。
4月3日,许文思院士铜像落成揭幕。
5月20日,全国“释药系统技术研讨会” 在制剂中心召开。药品包装材料科研检测中心陆续通过两项国家认证,4月通过国家计量认证委员会复评审,获“计量认证证书”;5月通过中国合格评定国家认可委员会初次评审,获“实验室认可证书”。
7月19日,国务院国资委副主任李伟视察我院。
9月,国资委发布“央企科技创新能力排名研究”报告,我院2006年年创新能力排名第13位。
11月,国资委公布央企2004-2006年任期经营业绩考核结果,我院为B级,是转制院所中业绩较好的企业之一。
11月,上海市知识产权局批准我院为上海市专利工作示范企业。
11月,我院选举产生第八届工会委员会和第八届工会经审委员会。
11月,制剂中心建设项目通过预备期验收。我院通过首批企业国家重点实验室建设申请,筹备成立“创新药物与制药工艺”国家重点实验室。
12月,王文梅研究员获2007年度中国药学发展奖天力士力创新药物奖。
 
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